Gon Freecss, um garoto de doze anos, um dia descobre que seu pai, que supostamente estava morto, estava vivo e bem. Seu Pai, Ging, é um Hunter, um membro de elite da sociedade com uma licença para ir a qualquer lugar ou fazer qualquer coisa. Gon, determinado a seguir os passos de seu pai, decide fazer o exame para Hunter, e um dia encontrar seu pai para provar a si mesmo como um caçador em seu próprio direito. Mas, no caminho, ele descobre que existe muito mais para se tornar um caçador, e os desafios que ele enfrentará são considerados os mais difíceis do mundo.